自考毕业生是有毕业档案的，从考生注册报名自考开始，考籍档案就已自动生成，自考档案袋里装的是毕业生登记表，表内有成绩和准予毕业的证明，不同省份内容不同，以实际收到的为准。
这份档案一般在领取毕业证时也一同领取毕业档案，以当地考办通知为准，但是和统招档案一样的是，自考档案也是需要托管到具有档案管理权限的单位，不能长久保管在自己手上。
那么自考本科的档案怎么处理？
1、有工作单位的自考生，如果工作单位有存放档案的资质，就把档案放在单位，一定要是有档案存放资历的单位，进入单位后，还会装入转正定级表、劳动合同、职称评审等材料。
2、没有工作单位的自考生毕业后可以选择将自己的档案放到所在地区的人才交流中心。
不过自考档案是不能单独存档的，不同阶段的考生需要注意：
1、如果你是统招专科，自考的本科，就只需要把自考本科拿到专科档案所在的托管地（通常是人才中心）进行档案合并即可。
2、如果专科和本科都是自考，就需要找到原来的高中或者中专档案，将档案放在一起，一起存放在人才中心。
以上就是关于自考本科毕业档案该如何处理的相关内容了，需要办理自考本科档案托管的朋友可以看一看。